摘要：目的分析云南省2例人感染H5N6禽流感病毒的基因特征,為將來的H5N6流感病毒的預(yù)防和控制提供科學(xué)依據(jù)。方法采集云南省2例肺炎患者的咽拭子以及居住地禽類相關(guān)外環(huán)境標(biāo)本,進(jìn)行禽流感病毒H5N6的基因檢測(cè),并將陽性標(biāo)本進(jìn)行高通量測(cè)序以獲得全基因組序列。利用MEGA軟件進(jìn)行序列比對(duì),分析H5N6禽流感病毒HA基因的功能性位點(diǎn)變異情況,并構(gòu)建HA基因系統(tǒng)發(fā)育樹進(jìn)行分析。結(jié)果全基因組序列分析結(jié)果顯示,云南省2例人感染H5N6禽病毒的8個(gè)基因片段序列同源性為98.5%~100.0%之間,與四川省、廣東省的人感染H5N6禽流感病毒基因比對(duì)分析發(fā)現(xiàn),除NP基因外,其他7個(gè)片段均有功能性位點(diǎn)的差異,導(dǎo)致其受體特異性改變、病毒毒力增強(qiáng)及耐藥性改變。HA基因進(jìn)化樹分析顯示,云南株、四川株及廣州株同屬于H5亞型2.3.4分支中的2.3.4.4亞支,云南省內(nèi)外環(huán)境分離的6株禽類H5N6病毒與云南省2例人H5N6病毒及廣州株有一定的親緣關(guān)系,歸于同一大簇。四川株與云南株及廣州株有一定的遺傳距離。結(jié)論云南省H5N6禽流感病毒在遺傳中存在著多樣性和復(fù)雜性,病毒基因功能性位點(diǎn)的變異可以是引起禽流感病毒跨種傳播的機(jī)制之一。因此,應(yīng)動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)活禽市場(chǎng)中的禽流感病毒的分布情況及基因變異特征,為研究禽流感病毒跨種傳播提供研究資料,同時(shí)為云南省禽流感病毒的防控提供科學(xué)依據(jù)。